Le 12/05/07, Charles Plessy<[EMAIL PROTECTED]> a écrit :
En attendant, voici une nouvelle mise à jour de microbio.wml,
Quelques corrections. -- Stephane.
--- microbio.wml.patch 2007-05-12 11:06:14.000000000 +0200 +++ modif.microbio.wml.patch 2007-05-12 11:21:29.000000000 +0200 @@ -37,9 +37,9 @@ + deb="http://packages.debian.org/unstable/science/melting";> + Calcule l'enthalpie, l'entropie et la température de fusion pour + l'appariement de deux oligonucléotides. Trois types d'hybridations sont -+ possibles: ADN/ADN, ADN/ARN et ARN/ARN. Ce programme calcule d'abords ++ possibles: ADN/ADN, ADN/ARN et ARN/ARN. Ce programme calcule d'abord + l'enthalpie et l'entropie d'hybridation à partir des paramètres élémentaires -+ de chaque apariement Watson-Crick par la méthode des plus proches voisins. La ++ de chaque appariement Watson-Crick par la méthode des plus proches voisins. La + température de fusion est ensuite calculée. Les paramètres thermodynamiques + peuvent facilement être changés pour rester proches des résultats + expérimentaux les plus récents. Il existe une interface graphique pour @@ -61,7 +61,7 @@ + MUMmer a été conçu pour aligner rapidement des génomes entiers, bruts ou + finis. Par exemple, MUMmer 3.0 peut trouver toutes les régions + identiques sur plus de 20 paires de bases entre deux génomes de 5 mégabases -+ en 13.7 secondes, sur un ordinateur tournant à 2.4 GHz en utilisant ++ en 13,7 secondes, sur un ordinateur tournant à 2,4 GHz en utilisant + 78 Mo de mémoire. MUMmer peut aussi aligner des génomes + incomplets ; il manipule les centaines ou les milliers de contigs d'un + projet de séquençage « shotgun » avec aisance, et les alignera sur @@ -152,7 +152,7 @@ + license="GPL" + deb="http://packages.debian.org/unstable/science/sigma-align";> + Sigma (simple alignement multiple glouton, <q>SImple Greedy Multiple -+ Alignment</q> en anglais), est un programme contenant un nouvel algorithme ++ Alignment</q> en anglais) est un programme contenant un nouvel algorithme + et un nouveau système d'évaluation conçu tout particulièrement pour les + séquences non-codantes. Sigma utilise comme stratégie la recherche du + meilleur alignement local possible sans indel (stratégie utilisée auparavant @@ -245,7 +245,7 @@ + url="http://bioinformatics.org/molekel/wiki/Main/HomePage"; + license="GPL"> + Molekel est un visualisateur moléculaire multi-plateforme et libre (GPL) -+ développé au Centre Suisse se de Calcul Scientifique (CSCS). ++ développé au Centre Suisse de Calcul Scientifique (CSCS). +</project> + +
