External Email - Use Caution Greetings freesurfuer community,
I've been working on a research project for which I need to simulate different levels of inflation for a given brain MRI, to achieve so I have tried the following so far: 1. To run recon-all for a test subject 2. To run mris_inflate over pial surfaces (as that's the structure I need for my simulation) 3. To try to get back to a .nifti file by using mri_surf2vol. However I have been unsuccessful with this step as the required --ribbon parameter refers to ribbon.mgz which is a binary mask of segmented tissue. My question: is there a way for me to generate a ribbon.mgz with the inflated brain, or does anyone know how to get an inflated version of the brain that I can use as an actual volume / image (.nifti, .mgz...)? Thanks in advance! -- *Aviso legal:* El contenido de este mensaje y los archivos adjuntos son confidenciales y de uso exclusivo de la Universidad Nacional de Colombia. Se encuentran dirigidos sólo para el uso del destinatario al cual van enviados. La reproducción, lectura y/o copia se encuentran prohibidas a cualquier persona diferente a este y puede ser ilegal. Si usted lo ha recibido por error, infórmenos y elimínelo de su correo. Los Datos Personales serán tratados conforme a la Ley 1581 de 2012 y a nuestra Política de Datos Personales que podrá consultar en la página web http://secure-web.cisco.com/12-1T4t5I3WmZta2EqCjvwIWHtQeGJkmeNAZoRBbnrgdUpKeF_P39DOnIWqL0NdA2ZSW-gDTJO4lhSEV7kAJOEyQbTAgV3dh2oObPBd4_2lPgylh-reDcJuKm4_UJ6iWQRwyvJLUEG8YCYi-mf_Y_JPT2LP5j_Z8pbd-9YIy_kfrqyX8QczbzivV-gBxX_1i4Nd94CVrtXg4EZSCXNPhNq7okkgQlmaQvZoQ6L40KmTQjDPrdPMXQN8uzP_bYLwu07ZXAUkqYa7-zKac4dTzofQ/http%3A%2F%2Fwww.unal.edu.co <http://secure-web.cisco.com/1ggE-ylwUekBVUwUxvozHFy8vy00YXExkO6K6A3ePYD9meHKcDkSLEDttaSLhCzeZsbR3XfAB07t5dpIThULdAX4k2fG8dS6rYD4l3AvweGUyhGYWHXlNoXD4Dj4BNZkcl18qoPmTTsdpe11e-o-LK_sDmbFnf4UmrMXIEaHcMfYt871K4YwvA1FlLM-YJBgYqjm4XkRJVvIpQf1zmB77v-My__GFHWpUxlu5KRyC3RFBybMSFJiXQSYNLKmrckub52ktLKUZhl-OnXqM4IzMyw/http%3A%2F%2Fwww.unal.edu.co%2F>.* *Las opiniones, informaciones, conclusiones y cualquier otro tipo de dato contenido en este correo electrónico, no relacionados con la actividad de la Universidad Nacional de Colombia, se entenderá como personales y de ninguna manera son avaladas por la Universidad.
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