Obrigado, deu certo!
André Oliveira Souza.
Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de
Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Sábado, 30 de Maio de 2015 10:38, Augusto Ribas <[email protected]>
escreveu:
ops, esse ja ta obsoleto
sudo apt-get install libtiff5-dev:i386 libtiff5-dev
o apt fala que esses dois substituem o anterior que tinha falado.
Em 30 de maio de 2015 09:36, Augusto Ribas <[email protected]> escreveu:
sudo apt-get install libtiff4-dev
Em 30 de maio de 2015 09:32, Andre Oliveira <[email protected]>
escreveu:
Continua reclamando da tiff, alguma sugestão?
..........................................................
tentando a URL
'http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz'Content
type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9
MB)==================================================downloaded 3.9 MB
* installing *source* package ‘tiff’ ...** package ‘tiff’ successfully unpacked
and MD5 sums checked** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG
-fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c common.c -o common.oIn file
included from common.c:1:0:common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou
diretório não encontrado #include <tiff.h> ^compilation
terminated.make: ** [common.o] Erro 1ERROR: compilation failed for package
‘tiff’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’ERROR:
dependency ‘tiff’ is not available for package ‘EBImage’* removing
‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
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Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Sábado, 30 de Maio de 2015 9:18, Augusto Ribas <[email protected]>
escreveu:
Opa, ele está reclamando que não tem todas as livrarias que precisa para
compitar.
Ta faltando do ffw3h.h
Ta usando linux certo?
No ubuntu, abra um terminal e instale os pacotes necessários com apt-get
sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config
depois tenta instalar denovo que vai funcionar.
Em 30 de maio de 2015 07:48, Andre Oliveira <[email protected]>
escreveu:
Pois é o erro que ocorre ..mas consegui identificar com clareza os motivos!
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R";)Bioconductor version 3.1
> (BiocInstaller 1.18.2), ?biocLite for help> biocLite("EBImage")BioC_mirror:
> http://bioconductor.orgUsing Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2),
> R version 3.2.0.Installing package(s) ‘EBImage’also installing the
> dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’
tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/tiff_0.1-5.tar.gz'Content
type 'application/x-gzip' length 28925 bytes (28
KB)==================================================downloaded 28 KB
tentando a URL
'http://cran.rstudio.com/src/contrib/fftwtools_0.9-7.tar.gz'Content type
'application/x-gzip' length 145998 bytes (142
KB)==================================================downloaded 142 KB
tentando a URL
'http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz'Content
type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9
MB)==================================================downloaded 3.9 MB
* installing *source* package ‘tiff’ ...** package ‘tiff’ successfully unpacked
and MD5 sums checked** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG
-fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c common.c -o common.oIn file
included from common.c:1:0:common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou
diretório não encontrado #include <tiff.h> ^compilation
terminated.make: ** [common.o] Erro 1ERROR: compilation failed for package
‘tiff’* removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’*
installing *source* package ‘fftwtools’ ...** package ‘fftwtools’ successfully
unpacked and MD5 sums checked** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include
-DNDEBUG -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c fftwtools.c -o
fftwtools.offtwtools.c:28:18: fatal error: fftw3.h: Arquivo ou diretório não
encontrado #include<fftw3.h> ^compilation terminated.make: **
[fftwtools.o] Erro 1ERROR: compilation failed for package ‘fftwtools’* removing
‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/fftwtools’ERROR: dependencies
‘tiff’, ‘fftwtools’ are not available for package ‘EBImage’* removing
‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpDc7Umf/downloaded_packages’Old
packages: 'car', 'tcltk2', 'MASS', 'spatial'Update all/some/none? [a/s/n]:
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Em Sexta-feira, 29 de Maio de 2015 21:03, Augusto Ribas
<[email protected]> escreveu:
O pacote é do biocondutor, você tentou instalar pela função biocLite?
####################################################
source("http://bioconductor.org/biocLite.R";)
biocLite("EBImage")
Em 29 de maio de 2015 18:54, Andre Oliveira <[email protected]>
escreveu:
Boa noite,existe alguma forma de fazer o cálculo da área da folha de uma árvore
no R? Tentei esta dica abaixo, mas não achei o pacote referido!
https://ridiculas.wordpress.com/page/2/
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