sudo apt-get install libtiff4-dev Em 30 de maio de 2015 09:32, Andre Oliveira <[email protected]> escreveu:
> Continua reclamando da tiff, alguma sugestão? > > .......................................................... > > > tentando a URL ' > http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz > ' > Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB) > ================================================== > downloaded 3.9 MB > > * installing *source* package ‘tiff’ ... > ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked > ** libs > gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 > -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat > -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c common.c -o common.o > In file included from common.c:1:0: > common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado > #include <tiff.h> > ^ > compilation terminated. > make: ** [common.o] Erro 1 > ERROR: compilation failed for package ‘tiff’ > * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’ > ERROR: dependency ‘tiff’ is not available for package ‘EBImage’ > * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’ > > > > > André Oliveira Souza. > > Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto > Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES > > > > > > > Em Sábado, 30 de Maio de 2015 9:18, Augusto Ribas <[email protected]> > escreveu: > > > Opa, ele está reclamando que não tem todas as livrarias que precisa para > compitar. > > Ta faltando do ffw3h.h > > Ta usando linux certo? > > No ubuntu, abra um terminal e instale os pacotes necessários com apt-get > > > sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config > > > depois tenta instalar denovo que vai funcionar. > > > > Em 30 de maio de 2015 07:48, Andre Oliveira <[email protected]> > escreveu: > > Pois é o erro que ocorre ..mas consegui identificar com clareza os motivos! > > > > source("http://bioconductor.org/biocLite.R";) > Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), ?biocLite for help > > biocLite("EBImage") > BioC_mirror: http://bioconductor.org > Using Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), R version 3.2.0. > Installing package(s) ‘EBImage’ > also installing the dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’ > > tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/tiff_0.1-5.tar.gz' > Content type 'application/x-gzip' length 28925 bytes (28 KB) > ================================================== > downloaded 28 KB > > tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/fftwtools_0.9-7.tar.gz > ' > Content type 'application/x-gzip' length 145998 bytes (142 KB) > ================================================== > downloaded 142 KB > > tentando a URL ' > http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz > ' > Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB) > ================================================== > downloaded 3.9 MB > > * installing *source* package ‘tiff’ ... > ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked > ** libs > gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 > -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat > -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c common.c -o common.o > In file included from common.c:1:0: > common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado > #include <tiff.h> > ^ > compilation terminated. > make: ** [common.o] Erro 1 > ERROR: compilation failed for package ‘tiff’ > * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’ > * installing *source* package ‘fftwtools’ ... > ** package ‘fftwtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked > ** libs > gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 > -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat > -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c fftwtools.c -o > fftwtools.o > fftwtools.c:28:18: fatal error: fftw3.h: Arquivo ou diretório não > encontrado > #include<fftw3.h> > ^ > compilation terminated. > make: ** [fftwtools.o] Erro 1 > ERROR: compilation failed for package ‘fftwtools’ > * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/fftwtools’ > ERROR: dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’ are not available for package > ‘EBImage’ > * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’ > > The downloaded source packages are in > ‘/tmp/RtmpDc7Umf/downloaded_packages’ > Old packages: 'car', 'tcltk2', 'MASS', 'spatial' > Update all/some/none? [a/s/n]: > > > > > > André Oliveira Souza. > > Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto > Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES > > > > > > > Em Sexta-feira, 29 de Maio de 2015 21:03, Augusto Ribas < > [email protected]> escreveu: > > > O pacote é do biocondutor, você tentou instalar pela função biocLite? > > #################################################### > source("http://bioconductor.org/biocLite.R";) > biocLite("EBImage") > > > Em 29 de maio de 2015 18:54, Andre Oliveira <[email protected]> > escreveu: > > Boa noite, > existe alguma forma de fazer o cálculo da área da folha de uma árvore no > R? Tentei esta dica abaixo, mas não achei o pacote referido! > > https://ridiculas.wordpress.com/page/2/ > > > > > > André Oliveira Souza. > > Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto > Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES > > > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > [email protected] > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > > > > -- > Grato > Augusto C. A. Ribas > > Site Pessoal: http://recologia.com.br/ > <http://augustoribas.heliohost.org/> > Github: https://github.com/Squiercg > Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056 > > > > > > -- > Grato > Augusto C. A. Ribas > > Site Pessoal: http://recologia.com.br/ > <http://augustoribas.heliohost.org/> > Github: https://github.com/Squiercg > Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056 > > > -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://recologia.com.br/ <http://augustoribas.heliohost.org> Github: https://github.com/Squiercg Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056
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