Hello-- I'm getting this error when running glmfit: ERROR: matrix is ill-conditioned or badly scaled, condno = 31165.5
>From what I've found in the archives this error seems to be caused by either one class only having one member or an incompatible file format. Neither of these seems to be the issue in this case so any suggestions would be greatly appreciated. I've attached a copy of the fsgd file I'm using (only the first several lines of data). Thanks Sarah Banducci This is the design matrix output in the terminal window- Design matrix ------------------ 0.000 1.000 0.000 -5.018 0.000 1.909 0.000 0.933 0.000 0.900 0.000 0.840; 1.000 0.000 1.982 0.000 -0.091 0.000 0.850 0.000 0.850 0.000 0.723 0.000; 1.000 0.000 -3.018 0.000 -4.091 0.000 0.790 0.000 0.325 0.000 0.257 0.000; 0.000 1.000 0.000 11.982 0.000 -2.091 0.000 0.777 0.000 0.839 0.000 0.652; 0.000 1.000 0.000 4.982 0.000 1.909 0.000 0.733 0.000 0.600 0.000 0.440; 0.000 1.000 0.000 9.982 0.000 -4.091 0.000 0.850 0.000 0.500 0.000 0.425; 0.000 1.000 0.000 -2.018 0.000 5.909 0.000 0.747 0.000 0.572 0.000 0.427; 1.000 0.000 12.982 0.000 -2.091 0.000 0.517 0.000 0.467 0.000 0.241 0.000; 1.000 0.000 -5.018 0.000 9.909 0.000 0.900 0.000 0.825 0.000 0.743 0.000; 0.000 1.000 0.000 0.982 0.000 -0.091 0.000 0.790 0.000 0.800 0.000 0.632; 1.000 0.000 -1.018 0.000 -4.091 0.000 0.813 0.000 0.925 0.000 0.752 0.000; 0.000 1.000 0.000 3.982 0.000 -0.091 0.000 0.887 0.000 0.591 0.000 0.524; 0.000 1.000 0.000 -5.018 0.000 7.909 0.000 0.917 0.000 0.750 0.000 0.688; 0.000 1.000 0.000 7.982 0.000 1.909 0.000 0.817 0.000 0.800 0.000 0.653; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 -0.091 0.000 0.927 0.000 0.475 0.000 0.440; 0.000 1.000 0.000 1.982 0.000 -0.091 0.000 0.807 0.000 0.486 0.000 0.392; 0.000 1.000 0.000 -2.018 0.000 -2.091 0.000 0.877 0.000 0.768 0.000 0.674; 0.000 1.000 0.000 3.982 0.000 -4.091 0.000 0.843 0.000 0.342 0.000 0.288; 0.000 1.000 0.000 -1.018 0.000 -2.091 0.000 0.750 0.000 0.550 0.000 0.412; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 7.909 0.000 0.943 0.000 0.800 0.000 0.755; 0.000 1.000 0.000 9.982 0.000 -0.091 0.000 0.417 0.000 0.550 0.000 0.229; 0.000 1.000 0.000 0.982 0.000 0.909 0.000 0.873 0.000 0.899 0.000 0.785; 0.000 1.000 0.000 -3.018 0.000 -0.091 0.000 0.927 0.000 0.775 0.000 0.718; 0.000 1.000 0.000 6.982 0.000 -3.091 0.000 0.910 0.000 0.750 0.000 0.683; 0.000 1.000 0.000 4.982 0.000 -0.091 0.000 0.860 0.000 0.850 0.000 0.731; 1.000 0.000 -1.018 0.000 5.909 0.000 0.827 0.000 0.800 0.000 0.661 0.000; 0.000 1.000 0.000 -0.018 0.000 5.909 0.000 0.943 0.000 0.725 0.000 0.684; 0.000 1.000 0.000 2.982 0.000 7.909 0.000 0.900 0.000 0.775 0.000 0.697; 0.000 1.000 0.000 -2.018 0.000 -9.091 0.000 0.667 0.000 0.625 0.000 0.417; 1.000 0.000 4.982 0.000 -4.091 0.000 0.677 0.000 0.375 0.000 0.254 0.000; 0.000 1.000 0.000 -1.018 0.000 -0.091 0.000 0.860 0.000 0.725 0.000 0.623; 1.000 0.000 -0.018 0.000 -4.091 0.000 0.877 0.000 0.900 0.000 0.789 0.000; 1.000 0.000 4.982 0.000 -4.091 0.000 0.837 0.000 0.922 0.000 0.772 0.000; 0.000 1.000 0.000 -3.018 0.000 -0.091 0.000 0.867 0.000 0.775 0.000 0.672; 0.000 1.000 0.000 3.982 0.000 3.909 0.000 0.483 0.000 0.642 0.000 0.310; 1.000 0.000 -1.018 0.000 1.909 0.000 0.710 0.000 0.900 0.000 0.639 0.000; 0.000 1.000 0.000 -0.018 0.000 -2.091 0.000 0.907 0.000 0.750 0.000 0.680; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 -4.091 0.000 0.783 0.000 0.800 0.000 0.627; 0.000 1.000 0.000 -2.018 0.000 -0.091 0.000 0.867 0.000 0.925 0.000 0.802; 1.000 0.000 -5.018 0.000 2.909 0.000 0.837 0.000 0.825 0.000 0.690 0.000; 1.000 0.000 -5.018 0.000 -0.091 0.000 0.973 0.000 0.850 0.000 0.827 0.000; 0.000 1.000 0.000 2.982 0.000 -4.091 0.000 0.777 0.000 0.600 0.000 0.466; 1.000 0.000 -5.018 0.000 3.909 0.000 0.950 0.000 0.950 0.000 0.902 0.000; 1.000 0.000 -4.018 0.000 -2.091 0.000 0.900 0.000 0.870 0.000 0.783 0.000; 0.000 1.000 0.000 -1.018 0.000 -4.091 0.000 0.807 0.000 0.850 0.000 0.686; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 -4.091 0.000 0.817 0.000 0.475 0.000 0.388; 0.000 1.000 0.000 -3.018 0.000 -0.091 0.000 0.923 0.000 0.900 0.000 0.831; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 -0.091 0.000 0.407 0.000 0.575 0.000 0.234; 0.000 1.000 0.000 1.982 0.000 -4.091 0.000 0.777 0.000 0.825 0.000 0.641; 0.000 1.000 0.000 -5.018 0.000 1.909 0.000 0.937 0.000 0.950 0.000 0.890; 0.000 1.000 0.000 -3.018 0.000 2.909 0.000 0.923 0.000 0.925 0.000 0.854; 1.000 0.000 -1.018 0.000 -1.091 0.000 0.740 0.000 0.785 0.000 0.581 0.000; 1.000 0.000 1.982 0.000 -2.091 0.000 0.760 0.000 0.700 0.000 0.532 0.000; 0.000 1.000 0.000 4.982 0.000 2.909 0.000 0.883 0.000 0.775 0.000 0.685; 1.000 0.000 9.982 0.000 0.909 0.000 0.783 0.000 0.650 0.000 0.509 0.000; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 -0.091 0.000 0.860 0.000 0.825 0.000 0.710; 0.000 1.000 0.000 2.982 0.000 1.909 0.000 0.950 0.000 0.950 0.000 0.902; 1.000 0.000 0.982 0.000 1.909 0.000 0.780 0.000 0.700 0.000 0.546 0.000; 1.000 0.000 -5.018 0.000 -0.091 0.000 0.917 0.000 0.825 0.000 0.756 0.000; 0.000 1.000 0.000 -2.018 0.000 1.409 0.000 0.923 0.000 0.750 0.000 0.692; 1.000 0.000 -4.018 0.000 3.909 0.000 0.817 0.000 0.863 0.000 0.704 0.000; 0.000 1.000 0.000 0.982 0.000 0.909 0.000 0.883 0.000 0.700 0.000 0.618; 1.000 0.000 4.982 0.000 3.909 0.000 0.833 0.000 0.800 0.000 0.667 0.000; 0.000 1.000 0.000 -0.018 0.000 -2.091 0.000 0.843 0.000 0.975 0.000 0.822; 0.000 1.000 0.000 -0.018 0.000 -4.091 0.000 0.860 0.000 0.768 0.000 0.661; 1.000 0.000 -0.018 0.000 0.909 0.000 0.850 0.000 0.850 0.000 0.723 0.000; 0.000 1.000 0.000 7.982 0.000 -0.091 0.000 0.860 0.000 0.806 0.000 0.693; 0.000 1.000 0.000 -1.018 0.000 -1.091 0.000 0.833 0.000 0.950 0.000 0.792; 0.000 1.000 0.000 12.982 0.000 -4.091 0.000 0.530 0.000 0.737 0.000 0.391; 0.000 1.000 0.000 0.982 0.000 -0.091 0.000 0.823 0.000 0.225 0.000 0.185; 1.000 0.000 -3.018 0.000 -0.091 0.000 0.750 0.000 0.850 0.000 0.637 0.000; 0.000 1.000 0.000 -3.018 0.000 -0.091 0.000 0.860 0.000 0.775 0.000 0.666; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 2.909 0.000 0.860 0.000 0.775 0.000 0.666; 1.000 0.000 -5.018 0.000 2.909 0.000 0.807 0.000 0.850 0.000 0.686 0.000; 1.000 0.000 -3.018 0.000 -0.091 0.000 0.793 0.000 0.925 0.000 0.734 0.000; 1.000 0.000 -3.018 0.000 1.909 0.000 0.853 0.000 0.675 0.000 0.576 0.000; 1.000 0.000 2.982 0.000 -4.091 0.000 0.707 0.000 0.950 0.000 0.671 0.000; 0.000 1.000 0.000 -4.018 0.000 -2.091 0.000 0.717 0.000 0.450 0.000 0.322; 0.000 1.000 0.000 -1.018 0.000 -2.091 0.000 0.917 0.000 0.650 0.000 0.596; 1.000 0.000 -2.018 0.000 -0.091 0.000 0.933 0.000 0.900 0.000 0.840 0.000; 1.000 0.000 3.982 0.000 7.909 0.000 0.783 0.000 0.725 0.000 0.568 0.000; 1.000 0.000 -5.018 0.000 1.909 0.000 0.893 0.000 0.700 0.000 0.625 0.000; 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