Do you mean one for each subject? If you output a cluster number volume (--ocn) from mri_surfcluster, then you can pass the ocn to mri_segstats as a segmentation, and pass the mri_glmfit input (--y) as --in, then save the result as an ascii file with --avgwf.
doug On Wed, 29 Oct 2008, Carl Schultz wrote:
Dear all, I compared the mean curvature between two groups using the mri_glmfit command and the Monte carlo simulation. Is there a possibility to extract the smoothed average curvature values of the significant clusters for all subjects? Thank you in advance Best regards Christoph Schultz University of Jena Department of Psychiatry Germany ____________________ Universitätsklinikum Jena Körperschaft des öffentlichen Rechts und Teilkörperschaft der Friedrich-Schiller-Universität Jena Bachstraße 18, 07743 Jena Verwaltungsratsvorsitzender: Prof. Dr. Walter Bauer-Wabnegg; Medizinischer Vorstand: Prof. Dr. Klaus Höffken; Wissenschaftlicher Vorstand: Prof. Dr. Klaus Benndorf; Kaufmännischer Vorstand und Sprecher des Klinikumsvorstandes Rudolf Kruse Bankverbindung: Sparkasse Jena; BLZ: 830 530 30; Kto.: 221; Gerichtsstand Jena Steuernummer: 161/144/02978; USt.-IdNr. : DE 150545777 _______________________________________________ Freesurfer mailing list Freesurfer@nmr.mgh.harvard.edu https://mail.nmr.mgh.harvard.edu/mailman/listinfo/freesurfer
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