Comuqnue ripeto la domanda (ora molto piu` debian specific): in debian/jessie ci sono strumenti (leggeri) che mi permettono di gestire il filesystem di una macchina remota via web (insomma un file manager apache-php!).
Mi viene in mente un'estensione del server Caddy: https://caddyserver.com/docs/filemanager
Non credo che sia nei repository, ma รจ un singolo file binario che puoi scaricare dal sito.