Dann bleibt dir nur eine eventuelle Wiederherstellung aus einem alten Backup oder die Rettung der InnoDB-files; wenn diese existieren. Ab hier müsstest Du mit einem MySQL Fachmann sprechen. Das ist leider nicht mehr trivial :/
In der Regel könntest Du den DDoS abschwächen, wenn Du per iptables nur deine eigene IP zulässt oder in Virtuozzo die Sperren einrichtest.
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