Às 21:52 de 17/12/2024, Neotropical bat risk assessments escreveu:
Hi all,
Tnx for the varied suggestions. I tried the "cleaned up code" John
suggested with the same Mutate error message
No clue why an asterisk * was added to the message lines that were only
# comments.
Eons ago Hadley helped with the code with early versions of the original
GGPLOT and it has been modified a bit to reflect current packages and
worked when pasted into the R 4.4.0 console.
What has distressed me is the saved code lines worked some 8-10 months
back.
Below is a sample of the data. The one named Buzz.txt. Both dates and
time were defined as text characters, so not Excel coded date/times.
If anyone is able/willing to trouble shoot the code happy to go off list
and use direct email.
Species Location Date Time
Molspp Malvita 12/8/2024 17:30
Molspp Malvita 12/8/2024 17:30
Perkap Malvita 12/8/2024 18:29
Perkap Malvita 12/8/2024 18:47
Perkap Malvita 12/8/2024 18:47
Perkap Malvita 12/8/2024 18:47
Perkap Malvita 12/8/2024 18:49
Perkap Malvita 12/8/2024 18:49
Ptemac Malvita 12/8/2024 19:07
Ptemac Malvita 12/8/2024 19:09
Ptemac Malvita 12/8/2024 19:09
Permac Malvita 12/8/2024 19:11
Perkap Malvita 12/8/2024 19:13
Perkap Malvita 12/8/2024 19:21
Permac Malvita 12/8/2024 19:24
Permac Malvita 12/8/2024 19:44
Permac Malvita 12/8/2024 19:58
Ptemac Malvita 12/8/2024 19:58
Permac Malvita 12/8/2024 20:10
Ptemac Malvita 12/8/2024 20:13
Perkap Malvita 12/8/2024 20:14
Perkap Malvita 12/8/2024 20:14
Perkap Malvita 12/8/2024 20:17
Perkap Malvita 12/8/2024 20:19
Perkap Malvita 12/8/2024 20:19
Perkap Malvita 12/8/2024 20:20
Perkap Malvita 12/8/2024 20:20
Perkap Malvita 12/8/2024 20:21
Perkap Malvita 12/8/2024 20:22
Perkap Malvita 12/8/2024 20:23
Perkap Malvita 12/8/2024 20:25
Perkap Malvita 12/8/2024 20:26
Perkap Malvita 12/8/2024 20:26
Perkap Malvita 12/8/2024 20:27
Perkap Malvita 12/8/2024 20:28
Perkap Malvita 12/8/2024 20:28
Perkap Malvita 12/8/2024 20:29
Perkap Malvita 12/8/2024 20:29
Permac Malvita 12/8/2024 20:30
Perkap Malvita 12/8/2024 20:31
Perkap Malvita 12/8/2024 20:32
Perkap Malvita 12/8/2024 20:32
Perkap Malvita 12/8/2024 20:33
Perkap Malvita 12/8/2024 20:36
Perkap Malvita 12/8/2024 20:36
Perkap Malvita 12/8/2024 20:36
Perkap Malvita 12/8/2024 20:36
Perkap Malvita 12/8/2024 20:38
Perkap Malvita 12/8/2024 20:38
Perkap Malvita 12/8/2024 20:38
Perkap Malvita 12/8/2024 20:39
Perkap Malvita 12/8/2024 20:40
Perkap Malvita 12/8/2024 20:41
Perkap Malvita 12/8/2024 20:42
Perkap Malvita 12/8/2024 20:42
Perkap Malvita 12/8/2024 20:42
Perkap Malvita 12/8/2024 20:43
Perkap Malvita 12/8/2024 21:03
Perkap Malvita 12/8/2024 21:14
Perkap Malvita 12/8/2024 21:14
Perkap Malvita 12/8/2024 21:15
Perkap Malvita 12/8/2024 21:15
Perkap Malvita 12/8/2024 21:15
Perkap Malvita 12/8/2024 21:16
Perkap Malvita 12/8/2024 21:16
Perkap Malvita 12/8/2024 21:18
Perkap Malvita 12/8/2024 21:20
Perkap Malvita 12/8/2024 21:20
Perkap Malvita 12/8/2024 21:21
Perkap Malvita 12/8/2024 21:22
Perkap Malvita 12/8/2024 21:22
Perkap Malvita 12/8/2024 21:23
Perkap Malvita 12/8/2024 21:24
Perkap Malvita 12/8/2024 21:25
Permac Malvita 12/8/2024 21:25
Ptemac Malvita 12/8/2024 21:25
Permac Malvita 12/8/2024 21:27
Permac Malvita 12/8/2024 21:27
Perkap Malvita 12/8/2024 21:28
Perkap Malvita 12/8/2024 21:28
Perkap Malvita 12/8/2024 21:29
Perkap Malvita 12/8/2024 21:30
Perkap Malvita 12/8/2024 21:30
Perkap Malvita 12/8/2024 21:30
Perkap Malvita 12/8/2024 21:31
Perkap Malvita 12/8/2024 21:32
Perkap Malvita 12/8/2024 21:33
Perkap Malvita 12/8/2024 21:34
Perkap Malvita 12/8/2024 21:35
Perkap Malvita 12/8/2024 21:36
Perkap Malvita 12/8/2024 21:36
Perkap Malvita 12/8/2024 21:37
Permac Malvita 12/8/2024 21:37
Perkap Malvita 12/8/2024 21:39
Perkap Malvita 12/8/2024 21:39
Perkap Malvita 12/8/2024 21:39
Perkap Malvita 12/8/2024 21:41
Perkap Malvita 12/8/2024 21:41
Perkap Malvita 12/8/2024 21:42
Perkap Malvita 12/8/2024 21:43
Perkap Malvita 12/8/2024 21:43
Perkap Malvita 12/8/2024 21:44
Perkap Malvita 12/8/2024 21:46
Perkap Malvita 12/8/2024 21:47
Perkap Malvita 12/8/2024 21:49
Perkap Malvita 12/8/2024 21:49
Perkap Malvita 12/8/2024 21:50
Perkap Malvita 12/8/2024 21:50
Perkap Malvita 12/8/2024 21:51
Perkap Malvita 12/8/2024 21:51
Perkap Malvita 12/8/2024 21:53
Perkap Malvita 12/8/2024 21:53
Perkap Malvita 12/8/2024 21:53
Perkap Malvita 12/8/2024 21:54
Perkap Malvita 12/8/2024 21:54
Perkap Malvita 12/8/2024 21:55
Perkap Malvita 12/8/2024 21:57
Perkap Malvita 12/8/2024 21:57
Perkap Malvita 12/8/2024 21:57
Perkap Malvita 12/8/2024 21:57
Perkap Malvita 12/8/2024 21:58
Perkap Malvita 12/8/2024 21:59
Perkap Malvita 12/8/2024 21:59
Perkap Malvita 12/8/2024 22:00
Perkap Malvita 12/8/2024 22:00
Perkap Malvita 12/8/2024 22:01
Perkap Malvita 12/8/2024 22:01
Perkap Malvita 12/8/2024 22:01
Perkap Malvita 12/8/2024 22:01
Perkap Malvita 12/8/2024 22:02
Perkap Malvita 12/8/2024 22:02
Perkap Malvita 12/8/2024 22:02
Perkap Malvita 12/8/2024 22:03
Perkap Malvita 12/8/2024 22:03
Perkap Malvita 12/8/2024 22:57
Perkap Malvita 12/8/2024 22:59
Perkap Malvita 12/8/2024 22:59
Permac Malvita 12/8/2024 23:03
Permac Malvita 12/8/2024 23:03
Perkap Malvita 12/8/2024 23:04
Perkap Malvita 12/8/2024 23:04
Perkap Malvita 12/8/2024 23:04
Perkap Malvita 12/8/2024 23:04
Perkap Malvita 12/8/2024 23:07
Perkap Malvita 12/8/2024 23:07
Permac Malvita 12/8/2024 23:08
Permac Malvita 12/8/2024 23:08
Perkap Malvita 12/8/2024 23:09
Perkap Malvita 12/8/2024 23:09
Perkap Malvita 12/8/2024 23:10
Perkap Malvita 12/8/2024 23:10
Perkap Malvita 12/8/2024 23:12
Perkap Malvita 12/8/2024 23:13
Permac Malvita 12/8/2024 23:15
Perkap Malvita 12/8/2024 23:17
Permac Malvita 12/8/2024 23:17
Perkap Malvita 12/8/2024 23:18
Permac Malvita 12/8/2024 23:18
Permac Malvita 12/8/2024 23:18
Perkap Malvita 12/8/2024 23:19
Permac Malvita 12/8/2024 23:19
Perkap Malvita 12/8/2024 23:20
Permac Malvita 12/8/2024 23:20
Perkap Malvita 12/8/2024 23:21
Perkap Malvita 12/8/2024 23:22
Perkap Malvita 12/8/2024 23:22
Perkap Malvita 12/8/2024 23:22
Perkap Malvita 12/8/2024 23:23
Perkap Malvita 12/8/2024 23:23
Permac Malvita 12/8/2024 23:24
Permac Malvita 12/8/2024 23:24
Permac Malvita 12/8/2024 23:25
Permac Malvita 12/8/2024 23:25
Permac Malvita 12/8/2024 23:26
Permac Malvita 12/8/2024 23:26
Perkap Malvita 12/8/2024 23:28
Permac Malvita 12/8/2024 23:28
Permac Malvita 12/8/2024 23:29
Permac Malvita 12/8/2024 23:29
Perkap Malvita 12/8/2024 23:30
Perkap Malvita 12/8/2024 23:30
Perkap Malvita 12/8/2024 23:31
Perkap Malvita 12/8/2024 23:31
Perkap Malvita 12/8/2024 23:32
Perkap Malvita 12/8/2024 23:33
Perkap Malvita 12/8/2024 23:33
Perkap Malvita 12/8/2024 23:37
Perkap Malvita 12/8/2024 23:42
Perkap Malvita 12/8/2024 23:43
Perkap Malvita 12/8/2024 23:45
Perkap Malvita 12/8/2024 23:47
Perkap Malvita 12/8/2024 23:58
Perkap Malvita 12/8/2024 23:59
Perkap Malvita 12/8/2024 23:59
Perkap Malvita 12/9/2024 0:01
Perkap Malvita 12/9/2024 0:02
Perkap Malvita 12/9/2024 0:02
Perkap Malvita 12/9/2024 0:03
Perkap Malvita 12/9/2024 0:04
Perkap Malvita 12/9/2024 0:07
Perkap Malvita 12/9/2024 0:07
Perkap Malvita 12/9/2024 0:08
Perkap Malvita 12/9/2024 0:08
Perkap Malvita 12/9/2024 0:11
Perkap Malvita 12/9/2024 0:13
Perkap Malvita 12/9/2024 0:13
Perkap Malvita 12/9/2024 0:14
Perkap Malvita 12/9/2024 0:14
Perkap Malvita 12/9/2024 0:15
Perkap Malvita 12/9/2024 0:17
Perkap Malvita 12/9/2024 0:17
Perkap Malvita 12/9/2024 1:24
Perkap Malvita 12/9/2024 1:25
Perkap Malvita 12/9/2024 1:33
Perkap Malvita 12/9/2024 1:38
Permac Malvita 12/9/2024 1:40
Ptemac Malvita 12/9/2024 1:40
Permac Malvita 12/9/2024 2:36
Permac Malvita 12/9/2024 2:59
Perkap Malvita 12/9/2024 3:00
Perkap Malvita 12/9/2024 3:02
Perkap Malvita 12/9/2024 3:04
Perkap Malvita 12/9/2024 3:05
Perkap Malvita 12/9/2024 3:05
Perkap Malvita 12/9/2024 3:06
Permac Malvita 12/9/2024 3:09
Perkap Malvita 12/9/2024 3:10
Perkap Malvita 12/9/2024 3:11
Perkap Malvita 12/9/2024 3:11
Perkap Malvita 12/9/2024 3:12
Mormeg Malvita 12/9/2024 3:25
Sacil Malvita 12/9/2024 5:40
Perkap Malvita 12/9/2024 18:44
Perkap Malvita 12/9/2024 18:44
Ptemac Malvita 12/9/2024 18:52
Perkap Malvita 12/9/2024 18:54
Permac Malvita 12/9/2024 19:06
Perkap Malvita 12/9/2024 19:10
Perkap Malvita 12/9/2024 19:15
Perkap Malvita 12/9/2024 19:15
Perkap Malvita 12/9/2024 19:16
Perkap Malvita 12/9/2024 19:17
Perkap Malvita 12/9/2024 19:17
Perkap Malvita 12/9/2024 19:18
Perkap Malvita 12/9/2024 19:18
Perkap Malvita 12/9/2024 19:18
Perkap Malvita 12/9/2024 19:19
Perkap Malvita 12/9/2024 19:20
Perkap Malvita 12/9/2024 19:21
Perkap Malvita 12/9/2024 19:21
Perkap Malvita 12/9/2024 19:22
Permac Malvita 12/9/2024 19:22
Ptemac Malvita 12/9/2024 19:22
Perkap Malvita 12/9/2024 19:23
Perkap Malvita 12/9/2024 19:23
Perkap Malvita 12/9/2024 19:26
Perkap Malvita 12/9/2024 19:30
Perkap Malvita 12/9/2024 19:30
Perkap Malvita 12/9/2024 19:32
Perkap Malvita 12/9/2024 19:33
Perkap Malvita 12/9/2024 19:34
Perkap Malvita 12/9/2024 19:34
Perkap Malvita 12/9/2024 19:34
Perkap Malvita 12/9/2024 19:34
Perkap Malvita 12/9/2024 19:34
Perkap Malvita 12/9/2024 19:34
Perkap Malvita 12/9/2024 19:35
Perkap Malvita 12/9/2024 19:35
Perkap Malvita 12/9/2024 19:36
Perkap Malvita 12/9/2024 19:36
Perkap Malvita 12/9/2024 19:36
Perkap Malvita 12/9/2024 19:36
Perkap Malvita 12/9/2024 19:37
Perkap Malvita 12/9/2024 19:38
Perkap Malvita 12/9/2024 19:38
Perkap Malvita 12/9/2024 19:42
Perkap Malvita 12/9/2024 19:42
Perkap Malvita 12/9/2024 19:42
Perkap Malvita 12/9/2024 19:43
Perkap Malvita 12/9/2024 19:47
Perkap Malvita 12/9/2024 19:51
Perkap Malvita 12/9/2024 19:51
Perkap Malvita 12/9/2024 19:51
Perkap Malvita 12/9/2024 19:52
Perkap Malvita 12/9/2024 19:53
Perkap Malvita 12/9/2024 19:54
Perkap Malvita 12/9/2024 19:54
Perkap Malvita 12/9/2024 19:54
Perkap Malvita 12/9/2024 19:54
Perkap Malvita 12/9/2024 19:56
Perkap Malvita 12/9/2024 19:56
Perkap Malvita 12/9/2024 19:56
Perkap Malvita 12/9/2024 19:57
Perkap Malvita 12/9/2024 19:58
Perkap Malvita 12/9/2024 19:58
Perkap Malvita 12/9/2024 19:58
Perkap Malvita 12/9/2024 19:59
Perkap Malvita 12/9/2024 20:01
Perkap Malvita 12/9/2024 20:01
Perkap Malvita 12/9/2024 20:03
Perkap Malvita 12/9/2024 20:04
Perkap Malvita 12/9/2024 20:04
Permac Malvita 12/9/2024 20:07
Permac Malvita 12/9/2024 20:08
Perkap Malvita 12/9/2024 20:09
Perkap Malvita 12/9/2024 20:09
Perkap Malvita 12/9/2024 20:09
Perkap Malvita 12/9/2024 20:10
Perkap Malvita 12/9/2024 20:11
Perkap Malvita 12/9/2024 20:12
Perkap Malvita 12/9/2024 20:12
Perkap Malvita 12/9/2024 20:12
Perkap Malvita 12/9/2024 20:12
Perkap Malvita 12/9/2024 20:13
Perkap Malvita 12/9/2024 20:13
Perkap Malvita 12/9/2024 20:14
Perkap Malvita 12/9/2024 20:14
Perkap Malvita 12/9/2024 20:15
Perkap Malvita 12/9/2024 20:15
Perkap Malvita 12/9/2024 20:15
Perkap Malvita 12/9/2024 20:15
Perkap Malvita 12/9/2024 20:15
Perkap Malvita 12/9/2024 20:16
Perkap Malvita 12/9/2024 20:16
Perkap Malvita 12/9/2024 20:16
Perkap Malvita 12/9/2024 20:18
Perkap Malvita 12/9/2024 20:19
Perkap Malvita 12/9/2024 20:19
Perkap Malvita 12/9/2024 20:20
Perkap Malvita 12/9/2024 20:21
Perkap Malvita 12/9/2024 20:21
Perkap Malvita 12/9/2024 20:22
Perkap Malvita 12/9/2024 20:23
Perkap Malvita 12/9/2024 20:23
Perkap Malvita 12/9/2024 20:25
Perkap Malvita 12/9/2024 20:26
Perkap Malvita 12/9/2024 20:26
Perkap Malvita 12/9/2024 20:27
Perkap Malvita 12/9/2024 20:27
Perkap Malvita 12/9/2024 20:27
Perkap Malvita 12/9/2024 20:28
Perkap Malvita 12/9/2024 20:28
Perkap Malvita 12/9/2024 20:29
Perkap Malvita 12/9/2024 20:29
Perkap Malvita 12/9/2024 20:29
Perkap Malvita 12/9/2024 20:29
Perkap Malvita 12/9/2024 20:30
Perkap Malvita 12/9/2024 20:31
Perkap Malvita 12/9/2024 20:31
Perkap Malvita 12/9/2024 20:31
Perkap Malvita 12/9/2024 20:32
Perkap Malvita 12/9/2024 20:32
Perkap Malvita 12/9/2024 20:32
Perkap Malvita 12/9/2024 20:32
Perkap Malvita 12/9/2024 20:32
Perkap Malvita 12/9/2024 20:33
Perkap Malvita 12/9/2024 20:35
Perkap Malvita 12/9/2024 20:41
Perkap Malvita 12/9/2024 20:42
Perkap Malvita 12/9/2024 20:43
Perkap Malvita 12/9/2024 20:44
Permac Malvita 12/9/2024 20:44
Perkap Malvita 12/9/2024 20:45
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https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/r-help
PLEASE do read the posting guide https://www.R-project.org/posting-
guide.html
and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
Hello,
Here is working code, tested with the data in a file "Buzz.txt". Adapted
from John's code, simplifed and corrected.
Note that the mutate is simpler and that there's only one facet_*.
library(tidyverse)
theme_set(theme_bw())
fname <- "Buzz.txt"
All <- read.table(fname, header = TRUE)
# Function for time labels: This uses Night and Time for X-Y labels
evening <- function(datetime) {
update(datetime
, yday = yday(datetime) - if_else(am(datetime), 1, 0)
, hour = 17
, minute = 0
, second = 0)
}
# Create labels and corresponding breaks for the time in seconds
label_hours <- c("17:00", "18:00", "19:00", "20:00", "21:00", "22:00",
"23:00",
"00:00", "01:00", "02:00", "03:00", "04:00", "05:00",
"06:00")
break_hours <- c(0, 1:13*3600)
# No need to fix Date column, combine date/hour
# and use the file's date format directly
# Calculate elapsed time from 17:00 in seconds
polished <- All %>%
mutate(
datetime = as.POSIXct(paste(Date, Time, sep = " "),
"%m/%d/%Y %H:%M", tz = "UTC")
, evening = evening(datetime)
, Night = format(as.Date(evening), "%b %d, %Y")
, Time = as.double(datetime - evening, "secs")
) %>%
select(-datetime, -evening) # auxiliary variables no longer needed
ggplot(polished, aes(x = Night, y = Time, colour = Species)) +
geom_point() +
scale_colour_hue(l = 40) +
scale_y_continuous(labels = label_hours, breaks = break_hours) +
ggtitle(label = 'Feeding buzz temporal activity') +
facet_wrap(facets = ~ Species) +
theme(axis.text.x = element_text(angle = 270))
It's also possible to pipe the data cleansing directly to ggplot without
saving 'polished'.
All %>%
mutate(
datetime = as.POSIXct(paste(Date, Time, sep = " "),
"%m/%d/%Y %H:%M", tz = "UTC")
, evening = evening(datetime)
, Night = format(as.Date(evening), "%b %d, %Y")
, Time = as.double(datetime - evening, "secs")
) %>%
# temp columns are no longer needed
select(-datetime, -evening) %>%
#
# now plot the cleaned data
#
ggplot(aes(x = Night, y = Time, colour = Species)) +
geom_point() +
scale_colour_hue(l = 40) +
scale_y_continuous(labels = label_hours, breaks = break_hours) +
ggtitle(label = 'Feeding buzz temporal activity') +
facet_wrap(facets = ~ Species) +
theme(axis.text.x = element_text(angle = 270))
Also, why color the points if the plots are already separated by
Species? Personally, I find it redundant, it adds no information to the
plot.
Unless you want other stuff added to the plot, I would remove
colour = Species
and the
scale_color_hue
aesthetic.
Hope this helps,
Rui Barradas
--
Este e-mail foi analisado pelo software antivírus AVG para verificar a presença
de vírus.
www.avg.com
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