install.packages('sos') # if you do not already have it
library(sos)
TH <- ???TukeyHSD
#found 27 matches; retrieving 2 pages
TH # The print method displays the results in a table in a web browser
This suggests you might also be interested in "multcompView".
Unfortunately, I failed to receive the news when it was removed from
CRAN, because the package had an obsolete email address for me. The
package will be back on CRAN by the end of this month. In the meantime,
I trust you can install.packages from the attached zip file.
Hope this helps.
Spencer Graves
On 10/4/2010 11:33 PM, Peter Dalgaard wrote:
Please, the language of the mailing list is English. A majority of
readers do not understand what you are talking about.
The Tukey test was designed for comparing means in equal replication
ANOVA. Some "folklore" suggests that it may work reasonably for
not-too-unequal replication cases, but I wouldn't trust it in the
general case, and in particular not for arbitrary glm() models.
Look ínto the multcomp package instead.
-pd
On 10/05/2010 07:48 AM, Lena Neuenkamp wrote:
Hallo,
zur Analyse von Daten zum Artenreichtum von Pflanzen, habe ich ein Glm (glm)
und anschlieÃend eine Anova (anova) durchgeführt. Nun möchte ich für die
signifikanten Einflussfaktoren einen Post Hoc Tukey Test durchführen, um zu
ermitteln in wie weit die einzelnen Faktorstufen sich signifikant
voneinander unterscheiden.
Mit dem Befehl (TukeyHSD) komme ich nicht weiter, weil derscheinbar mit den
Ergebnissen der Anova nihct zurecht kommt. Er basiert wohl auf aov-
Datentypen. Führe ich die Anova dann mit dem Befehl aov durch und dann den
Tukey Test, bekomme ich als Antwort, dass keine Faktoren im gefitteten Model
vorhanden sind.
Gibt es eine Möglichkeit den Tukey Test an ein GLM anzuschlieÃen, wenn ja,
wie?
Vielen Dank
Lena
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