Vc precisa transformar a tabela do formate wide para long. Existem varias formas. Aqui tem um exemplo
https://www.datasciencemadesimple.com/reshape-in-r-from-wide-to-long-from-long-to-wide/ <https://www.datasciencemadesimple.com/reshape-in-r-from-wide-to-long-from-long-to-wide/> daniel > On May 25, 2022, at 8:01 AM, Michele Claire Breton por (R-br) > <[email protected]> wrote: > > Caríssimos(as) colegas(as), muito bom dia! > > Espero que todos se encontrem bem. > > Estou com uma dificuldade. Quero fazer um bubble plot usando as funções > ggplot2 e dplyr, onde pretendo plotar no eixo x o gene_ID (são 84 linhas), no > y a % de ocorrência da expressão na célula e no color, o valor da expressão. > O meu primeiro problema é que no y são 9 tipos celulares diferentes e cada um > tem, na tabela de entrada de dados, uma coluna com os dados de expressão e > outra com os dados de % de ocorrência (amostra abaixo). Como eu escrevo a > função geom_point para plotar o gráfico? > > Amostra da tabela de entrada > gene BE-exp BE% CE_exp CE% E_exp E% F_exp F% HE_exp > HE% L-exp L% LE-exp LE% N-exp N% SM-exp SM% > ACTB 4.006 99.8 3.690 99.6 2.691 95.2 2.377 80.1 2.901 > 97.7 3.182 94.1 2.864 94.0 3.243 96.0 3.214 93.5 > ACTG1 3.850 5.9 3.592 7.1 2.469 1.5 2.252 1.1 3.129 > 6.4 2.451 0.6 2.979 1.1 3.104 0 2.500 2.4 > AJUBA 1.185 5.9 0.972 7.1 1.042 1.5 0.912 1.1 1.043 > 6.4 0.865 0.6 1.024 1.1 0 0 1.149 2.4 > > Muitíssimo obrigada pela ajuda! > > Michele > > > > -- > ------------------------------------------------------------------------ > Dra. Michele Claire Breton > Técnica Superior em Bioinformática > CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde > Faculdade de Ciências da Saúde > Universidade da Beira Interior > Covilhã - Castelo Branco - Portugal > _______________________________________________ > R-br mailing list > [email protected] > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código > mínimo reproduzível.
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