Delineamento explicado, Carolina! Resta saber se a chamada à função no R indica isso ou se ele considerou cada uma das três amostras por mês como um "fator" ou coisa que o valha e por isso não enxerga a multiplicidade para o mês × profundidade.
Sem mais detalhes, por óbvio, é difícil ser assertivo, *mas* considerando o objetivo do pacote que usa médias baseadas em componentes principais, que é uma técnica usada quando se tem muitas variáveis (e especialmente correlacionadas entre si) e os seus dados, me pergunto se uma ANOVA mais convencional não seria suficiente para ajudá-la a responder a questão da pesquisa. HTH -- Cesar Rabak On Sat, Apr 17, 2021 at 6:52 PM Carolina Lopes por (R-br) < [email protected]> wrote: > Prezado Cesar. > Tenho 216 amostras nas quais eu contabilizei o número total de moluscos. > São 6 profundidades, 12 meses e foi em triplicata. Para cada profundidade > eu tenho 3 amostras por mês. > Para cada mês, 18 amostras. > Eu gostaria de verificar se existe diferença entre as profundidades em > cada mês. > > Espero que eu tenha conseguido explicar melhor o delineamento. > > Agradeço a atenção. > __________________________________________________________________________ > Dra. Carolina A. Lopes > Pesquisadora - Pós-doutorado > Universidade Federal de Santa Catarina - UFSC > > ------------------------------ > *De:* R-br <[email protected]> em nome de Cesar Rabak por > (R-br) <[email protected]> > *Enviado:* quinta-feira, 15 de abril de 2021 21:19 > *Para:* a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. < > [email protected]> > *Cc:* Cesar Rabak <[email protected]> > *Assunto:* Re: [R-br] Teste de Pairwise para PERMANOVA > > Carolina, > > Sem saber mais detalhes sobre os dados é difícil escapar do campo dos > "palpites", mas a mensagem parece indicar que o número de casos para as > permutações não tem nenhum grau de liberdade, você por acaso tem apenas 72 > caso no total? > > > On Thu, Apr 15, 2021 at 1:43 PM Carolina Lopes por (R-br) < > [email protected]> wrote: > > Prezados. > > Estou fazendo algumas analises mas estou insegura. > Coletei moluscos por 12 meses em 6 profundidades diferentes. > Rodei uma PERMANOVA e a interação entre meses e profundidade foi > significativa. > Agora gostaria de verificar as diferenças entre profundidades dentro de > cada mês. > Quando rodo a pairwise da PERMANOVA aparece a seguinte mensagem: > Set of permutations < 'minperm'. Generating entire set.'nperm' >= set of > all permutations: complete enumeration. > > Li algumas coisas que talvez eu deveria definir um design de permutação. > > Alguém poderia me ajudar? > > Atenciosamente > __________________________________________________________________________ > Dra. Carolina A. Lopes > Pesquisadora - Pós-doutorado > Universidade Federal de Santa Catarina - UFSC > ------------------------------ > *De:* R-br <[email protected]> em nome de Cesar Rabak por > (R-br) <[email protected]> > *Enviado:* quarta-feira, 14 de abril de 2021 14:48 > *Para:* a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. < > [email protected]> > *Cc:* Cesar Rabak <[email protected]>; Chiara Lubich < > [email protected]> > *Assunto:* Re: [R-br] Regressão não linear > > Chiara, > > Você menciona « … esse tipo de distribuição … ». > > Qual tipo você acha que é? > > Pelos nomes que deste aos eixos, parece que a variável dependente é > inteira¹ ("Qtde. de artigos [N]"), por outro lado, a variável independente > é um ano calendário, que por definição é uma variável ordinal arbitrária (a > faixa 1994 -- 2021 poderia ser noutros calendários diferente, por exemplo > no Bahá'i de 157 a 178, etc.). > > Para decidir por uma regressão (de qualquer tipo) antes de mais nada > deve-se refletir sobre o fenômeno e a modelagem que o *processo* que gera > esses dados. > > As regressões são abordagens que nos permitem fazer ajustes dos dados > experimentais à essas hipóteses modeladas e enfrenta os dois problemas dos > dados obtidos por meio de observação: a) amostragem; b) perturbações que > geram erros nas observações, modeladas como "ruído" ou "erros" com > distribuição gaussiana de média zero e variância em função da dispersão dos > dados vis-à-vis à abstração matemática (equação da regressão). > > Daí a sua confusão sobre « … como são feitas as escolhas para valores de > a=?, b=? e c=? » ser esperada. > > A equação da regressão ("não linear") propõe uma complexa equação > exponencia multiplicada pela variável independente, etc. > > O quê você precisa responder é: essa curva descreve um processo que > explica a geração dos dados que está em análise? > > OBS.: Faz sentido incluir um ano que ainda não acabou numa regressão que > conta eventos por unidade de ano calendário? > > HTH > -- > Cesar Rabak > > [1] Mais importante, parece ser o tipo de dados "de contagem" que tem > outras restrições, como não poder ser menor que zero, etc. > > On Wed, Apr 14, 2021 at 12:01 PM Chiara Lubich por (R-br) < > [email protected]> wrote: > > Bom dia, > Pessoal, fiz a plotagem dos meu dados: > ano n > 1994 1 > 1996 1 > 2001 1 > 2002 1 > 2004 1 > 2005 3 > 2006 3 > 2007 2 > 2008 4 > 2009 1 > 2010 3 > 2011 2 > 2012 5 > 2013 4 > 2014 5 > 2015 3 > 2016 8 > 2017 2 > 2018 4 > 2019 3 > 2020 12 > 2021 2 > [image: image.png] > E vi na internet alguns vídeos em que gráficos que tinham esse tipo de > distribuição, era feito o uso de Regressão Não Linear, por meio da função > "nls". No entanto, tentei começar a digitar os comandos, mas não entendi > como são feitas as escolhas para valores de a=?, b=? e c=?. > Segue o script abaixo: > plot(n ~ ano, data = chiara, xlab = "Ano da publicação", ylab = > "Quantidade de artigos (N)") > a_maximovalor=max(n) > modelo<-nls(y~x*(1-exp(-b*x))^c, data=chiara, start = list(a= > a_maximovalor, b=?, c=?)) > > Agradeço desde já pela colaboração > > _______________________________________________ > R-br mailing list > [email protected] > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > _______________________________________________ > R-br mailing list > [email protected] > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > > _______________________________________________ > R-br mailing list > [email protected] > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. >
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