Tito,
Você pode mostrar a imagem que está tentando abrir?
Idealmente, importá-la no R deveria ser tão fácil quanto isso:
library(raster)
r <- raster('A20072132007243.L3m_MO_CHL_chlor_a_4km')
Porém, dependendo de como o hdf estiver organizado, o mais recomendado é usar o
gdal_translate para converter a banda que você quer em um formato mais
acessível, digamos .tif:
system('gdal_translate -of GTiff
HDF4_SDS:SEAWIFS_L2:"S2006365040146.L2_GAC_OC":26
/home/thiago/Downloads/seawifs.tif')
library(raster)
r<-raster('seawifs.tif')
O comando acima converterá a banda 26 do arquivo S2006365040146.L2_GAC_OC no
arquivo seawifs.tif, que depois é facilmente aberto pelo raster.
Você pode ver as bandas disponíveis no HDF usando o gdalinfo ou abrindo o
arquivo no QGIS. Você precisará instalar o GDAL para usar essas ferramentas. Se
estiver no ubuntu, o pacote é o gdal-bin.
Saudações,
--
Thiago V. dos Santos
PhD student
Land and Atmospheric Science
University of Minnesota
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Sent: Monday, August 12, 2013 8:03 PM
Subject: Re: [R-br] Arquivos hdf
Benilton, o hdf5 não abre o arquivo
Thiago os arquivos são do seawifs, ao que parece não tem que processar a
imagem, o problema é abri-los mesmo
Tito Conte_______________________________________________
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