Marcelo,

O tipo de efeito (fixo, aleatório) muda a amplitude das inferências. Você
tem que definir os seus objetivos. Você terá algum trabalho matricial com
objetos de classe lmer. Por serem classes associadas à métodologias de
análise mais recentes, existem menos métodos no R para essas classes.
Existem métodos para classe lm/aov/glm (predict, contrast, TukeyHSD, glht,
estimable, fit.contrast, ...) que ainda não possuem versões para classes
lmer. Então é trabalho feito na mão, artesanato mesmo para obter contrastes,
comparações, predições.

À disposição.
Walmes.

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Walmes Marques Zeviani
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