Dear Susanna,
in addition to MD calculations I suggest you to perform a check on your
mutated protein. Circular dichroism is a simple technique that allows to
monitor the global fold of your protein.
Mutating a residue may affect the folding and this seems an
underestimated problem in the literature.
Best,
Marco Sette
Il 12/04/2022 16:34, susanna pagni ha scritto:
Hello,
I am quite new to PyMOL. I would like to assess how an amino acid change might
affect the protein structure. I used the Wizard Mutagenesis to change the amino
acid of interest but don’t know how I can see how the protein structure is
affected by the mutation.
Can you please help me with this?
Many thanks in advance.
Best wishes,
Susanna
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