一般都是环境变量PATH的问题 crontab或者cgi运行的时候，脚本和用户shell上的环境变量是不一样的
2011/10/17 Michael Zeng <[email protected]>: > system 命令正确执行是返回0的，否则是非0 ， > > 因此应该反过来写 : > ! system( "XXXXcmd" ) or die "system error : $! " > > > 2011/10/16 Yisong Zhen <[email protected]> >> >> 找到原因了。 >> 谢谢Robin。 >> 我检查了httpd的error_log，上面显示是没发现我需要运行的程序-dialign。 >> 我估计还是环境变量没有设置好。 >> CGI在调用外部命令的时候没有调用apache运行用户的设置。这一点我不知道是否理解的对。 >> 所以我重新指定环境变量PATH和DIALIGN2_DIR(如果在本地执行，这些变量设置当然是对的，所以一开始并没有找到错误点!) >> >> 谢谢大家！ >> >> 一松 >> >> 2011/10/16 Robin Lee <[email protected]>: >> > 那就是没有错误。 >> > 你确定system里的命令没有被执行？ >> > 试一下 system("echo 'xxx'") ? >> > >> > 另外，应该判断 system 返回值是否为0来判断命令是否正确执行： >> > system("xxx") == 0 or die; >> > 而不是： >> > system("xxx") or die; >> > >> > 另外，system的返回值并不是命令结束返回值，返回值是 ($? >> 8)。详见 perldoc -v '$?' 以及 perldoc -f >> > system。 >> > >> > 2011/10/15 Yisong Zhen <[email protected]>: >> >> 没有什么额外的信息，只是说程序的第9行： >> >> die cannot excute the proram: at temp.pl line 9. >> >> >> >> 一松 >> >> >> >> 2011/10/15 Robin Lee <[email protected]>: >> >>> 改用 >> >>> die "cannot excute the proram: $!" >> >>> 看看有什么系统错误信息 >> >>> >> >>> 2011/10/15 Yisong Zhen <[email protected]>: >> >>>> 诸位，一个小问题： >> >>>> >> >>>> 该脚本运行在Fedora15上面：但是无法执行system里面的程序。但是，程序不用借助perl外部调用可以正确执行。 >> >>>> 即，我直接在linux命令行敲入：dialign2-2 -fn promoter.out -n promoter.seq >> >>>> 可以执行程序。 >> >>>> >> >>>> 起初我觉得是路径不对，我输出了路径，发现是正确的，而且所需的DIALIGN2_DIR变量也设置正确。 >> >>>> 代码如下： >> >>>> >> >>>> #!/usr/bin/perl >> >>>> >> >>>> #my $dir = $ENV{'DIALIGN2_DIR'}; >> >>>> #my $path = $ENV{'PATH'}; >> >>>> >> >>>> >> >>>> my $commandLine = "dialign2-2 -fn promoter.out -n >> >>>> promoter.seq"; >> >>>> my $returnValue = system($commandLine) || die "cannot excute >> >>>> the proram"; >> >>>> >> >>>> 非常感谢能有人出手帮助。 >> >>>> >> >>>> 甄一松 >> >> >> >> -- >> >> -- >> 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的"PerlChina Mongers 讨论组"论坛。 >> 要向此网上论坛发帖，请发送电子邮件至 [email protected]。 >> 要取消订阅此网上论坛，请发送电子邮件至 [email protected]。 >> 若有更多问题，请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。 >> > > > > -- > Yours Sincerely > Zeng Hong > > -- > 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的"PerlChina Mongers 讨论组"论坛。 > 要向此网上论坛发帖，请发送电子邮件至 [email protected]。 > 要取消订阅此网上论坛，请发送电子邮件至 [email protected]。 > 若有更多问题，请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。 > -- 如果觉得无聊，您不妨访问Google Reader消遣 https://www.google.com/reader/view 要尝试黑版本Google，请访问 http://tinyurl.com/yk3yp7j -- 您收到此邮件是因为您订阅了 Google 网上论坛的"PerlChina Mongers 讨论组"论坛。 要向此网上论坛发帖，请发送电子邮件至 [email protected]。 要取消订阅此网上论坛，请发送电子邮件至 [email protected]。 若有更多问题，请通过 http://groups.google.com/group/perlchina?hl=zh-CN 访问此网上论坛。
