一个简单的提高效率的办法：
在读入数据的同时进行处理，不要用反复的循环。
while(<FILE>)
{ my @itmes=split(/\s+/);
foreach (1..$#items)
{ next if $items[$_] eq 'NA';
$hash{$items[0]}->[$_]->{sum}+=$items[$_]; #这是总和
$hash{$items[0]}->[$_]->{count}++; #这是计数
}
}
这样在读取完输入文件后，进行遍历计数均值同时输出。
不过，这里可能会有一个bug，就是当某个key的某一个列全部是NA的情况下，就会完全不输出而被跳过……
总之，不能反复的做循环。
估计这样运行起来的时间应该也就是几分钟的事情。
jester，[email protected]
2010-09-08
----- Original Message -----
From: chunjiang he
To: perlchina
Sent: 2010-09-08, 00:33:57
Subject: [PerlChina] 求教一个算法
>求教一个算法，上次问过，但是还是没有搞清楚。
>
>比如有这样一个矩阵：
>
>sex 7.2 3.8 6.8 9.2 5.6
>sex 5.4 2.3 4.6 8.9 9.0
>sex 6.7 NA 7.8 9.0 3.1
>goo 2.4 6.7 NA 9.0 2.1
>goo 2.1 5.6 7.8 9.7 1.2
>pkk 2.5 4.3 6.5 4.9 0.2
>pkk 2.1 3.4 3.2 NA 4.6
>pkk 3.2 5.6 6.7 9.1 2.2
>...
>...
>...
>
>
>这个矩阵很简单，就是有一些同名的行，现在我要做的是，把这些同名的行的数据按每一列合并起来，按什么合并，按照每一列的平均值来合并
>
>就是说，比如行名为sex的行，第一列数据为: 7.2, 5.4, 6.7 那么第一列的平均值就是(7.2+5.4+6.7)/3=6.4,
>第二列数据为3.8, 2.3, NA, 那么平均值就是 (3.8+2.3)/2=3,
>以此类推，得到每一列的平均值，作为最后的值，那么行名为sex的行最后就合并为：
>sex 6.4 3 ....
>
>就是要写这样一个程序，原理很简单吧，但是鄙人的水平有限，写的程序效率上不去。
>
>我是这样写的，
>
>先用一个hash存下所有的行名：sex, goo, pkk.....
>
>然后遍历这个hash, foreach (%hash) { }
>
>每一次，把相同行名的行取出来放到一个数...@num中
>
>这个矩阵有一个值是确定的，那就是列数是确定的，所以对每一个数...@num, 我用for($i=0;$i<列数;$i++)
>循环，把每一列取出来，放到一个新的数...@haha中
>
>然后for($j=0;$j<@haha;$j++) �...@haha的平均值算出来，作为这一列的最后的值
>
>就是这样。。。
>
>程序我是写出来了，对于行数和列数都比较少的情况，程序没有什么问题。但是如果我有大量的行和列，比如有40000行，500列，这种情况下，这个程序就不是一两天能跑完的了。我跑了三天，还没有跑完。工作情况是不允许我跑这么久的。
>
>
>恳请高手们帮忙指教。非常感谢！
>
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