Olha, eu não tenho nenhuma certificação LPI ainda, mas prentendo ser pelo menos nível um antes de me formar. Na minha humilde opinião, a única maneira de estar preparado para qualquer uma das provas, além de estudar, é usar Linux no dia-a-dia. Ninguém aprende Linux sem usar.
Eu sou usuário Linux há uns três anos, e trabalho formalmente com isso há um ano, e mesmo assim existe uma parte do conteúdo das provas 101 e 102 que eu não conheço. Ainda mais que, hoje em dia as coisas estão muito mais acessíveis e existem muitas formas automáticas pra fazer o que antes só podia se feito manualmente. Particularmente, eu também acho que é necessário um pouco de bagagem primeiro, pra depois certificar-se. Nós fixamos mesmo o conhecimento quando fazemos uso dele. Um assunto que sempre desperta discussão entre meus colegas é: usar ou não os utilitários gráficos pras tarefas administrativas. Eu digo a todos: "Não usem". A questão é controversa, há quem diga que depende do perfil de quem usa o sistema, se você quer trabalhar com isso ou só se virar por hora e tal... Agora, se você quer ser um profissional dessa área, esqueça - saiba como fazer tudo manualmente. Ferramentas gráficas ajudam muito, mas nos impedem de aprender, e nos prendem a um ambiente que na maior parte das vezes não teremos disponível. A idéia de instalar o Gentoo me parece ótima - algo que aliás, eu nunca fiz. O fato é: use Linux. Viva dentro dele e entenda o máximo que puder de como ele funciona. Trabalhe com isso também, se for possível. Quando você souber o que fazer na maior parte das situações práticas com as quais for confrontado, daí sim você estará pronto para estudar e fazer a prova. Mesmo porque, a certificação tem que contar às pessoas a verdade sobre você. Você precisa realmente ter domínio daquela conteúdo, seja uns dias depois de fazer a prova, seja depois de anos, e isso a gente só consegue com a prática - exaustiva, ás vezes. =) Boa sorte. (Pra mim também) =)