XD funciona !!! lilo -r /mnt/a era lo que necesitaba, muchas gracias Bernardo.
Por cierto, ahora que se ha solucionado, sabeis por que me ha pasado esto. ¿El hecho de reiniciar la máquina desde una sesión remota ha podido influir en casacar el lilo? hasta ahora no tuve problemas con LILO ¿suele suceder que por las buenas se casque? más que nada, pregunto por curiosidad y para evitar nuevos incidentes :)