Saludos, Takeichi.
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Como knoppix es una distribución de Linux basada en Debian puedes usar
cualquier repositorio de Debian tanto para actualizar como para instalar
nuevos paquetes, sólo tienes que apt-get, por defecto el viene
configurado con un conjunto de repositorios desde donde puedes instalar,
esto lo puedes cambiar modificando el archivo /etc/apt/source.lists.
En cuanto lo que planteas sobre mysql knoppix si trae estos paquetes
instalados, sólo que se llaman mysql-server y mysql-client (entre otros).
