Finalmente, me han recomendado que aplicara un programa diferente del chkrootkit. Me he descragado y he aplicado el rkhunter:
http://www.rootkit.nl/projects/rootkit_hunter.html Después de aplicarlo me ha dado todo buen resultado, así que, alparecer, podría tratarse de un mal resultado del otro... O eso parece. Un saludo y gracias por vuestra ayuda. Josep
