Eduardo,
Voce pode criar um script de inicializacao do servico e coloca-lo no:
/etc/init.d/ftp-script
Depois, voce pode utilizar o:
update-rc.d
E importante ter o script que sobe o servico e um que derruba ...
colocando nos niveis de inicializacao corretos.
Sua vida podera ficar mais facil instalando:
apt-get install file-rc
Esse pacote coloca um arquivo com os dados de inicializacao dentro do
/etc ... e voce edita isso conforme sua necessidade ... sem ter de
altarar os diretorios do /etc/rc.d
Att,
Giuliano