Dear Lori Sheperd - Kern Awesome, thank you very much.
Have a great day :) Oliver De: "Kern, Lori" <lori.sheph...@roswellpark.org> À: "Olivier Cuvier" <olivier.cuv...@univ-tlse3.fr>, "bioc-devel" <bioc-devel@r-project.org> Envoyé: Jeudi 28 Mars 2024 12:19:38 Objet: Re: CuvierLab -Request to add maintainers for HicAggR I can assist with this and will be in touch with Dr. Tesfaye to set up a BiocCredentials account. Lori Shepherd - Kern Bioconductor Core Team Roswell Park Comprehensive Cancer Center Department of Biostatistics & Bioinformatics Elm & Carlton Streets Buffalo, New York 14263 From: Bioc-devel <bioc-devel-boun...@r-project.org> on behalf of Olivier Cuvier <olivier.cuv...@univ-tlse3.fr> Sent: Wednesday, March 27, 2024 6:29 PM To: bioc-devel@r-project.org <bioc-devel@r-project.org> Subject: [Bioc-devel] CuvierLab -Request to add maintainers for HicAggR Dear Colleagues I'd like to add Dr. Tesfaye - rob.t...@gmail.com - as a maintainer of CuvierLab HicAggR GitHub-Bioconductor package. Thank you for your help Best regards Oliver ************************************ Olivier Oliver Cuvier - Group Leader (Director of Med Research (DR) / Inserm) Laboratory of Chromatin Dynamics - Functional Genomics Unit of Molecular Cellular and Dev. Biology (MCD) Center of Biology Integrative (CBI) / CNRS-Toulouse +33-659 75 42 70 olivier.cuv...@inserm.fr olivier.cuv...@univ-tlse3.fr olivier.cuv...@gmail.com ************************************************************************ ----- Mail original ----- De: "Robel Tesfaye" <robel.tesf...@univ-tlse3.fr> À: "Olivier Cuvier" <olivier.cuv...@univ-tlse3.fr> Envoyé: Mercredi 27 Mars 2024 19:10:08 Objet: Re: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and compare_to_background functions Salut Olivier, Peux-tu t'occuper de ça rapidement s'il te plaît? Le reviewing est en attente tant que je ne leur push pas la nouvelle version sur le git bioc On 26/03/2024 19:27, Robel Tesfaye wrote: > > Salut Olivier, > > Il n'y a que ton (olivier.cuv...@univ-tlse3.fr) compte qui peut mettre > à jour la version du package présent sur le git de bioconductor. > > Donc afin d'ajouter une liste de gens qui sont maintainers, tu dois > confirmer qu'on a droit de push des changements au git bioconductor. > > Si tu veux plus de détails sur mes échanges avec bioc > > [ > https://secure-web.cisco.com/1Zegt_Gn2IBgqTP0oVVXaW-DevkpyjF3ysopH2xJUwv37_qzuLYswgriq8Nc59u268Y5WTBWX97BGNreUt_-gGpevznmdMWLcBsjwYaI7Sif52zsGAsTaYv2fQFhwmgff13Cl17cl-oRT5O0f_VKLdrrWbHHQxMYoE9o1zic2BMwGaXsjo5DVUVgF4H7A8rVmuoiEKOFL1FQrM26fHeMOfTcstCW1Z5a1uRVCUhLXDmgGTudC5BmKfYANy6T6uFBEaOQKdf6BUxONpCwijkr09QtQBuWHDYAC_qX3EO__aMwEbWEgDbUAqSkWh7OFpPby/https%3A%2F%2Fgithub.com%2FBioconductor%2FContributions%2Fissues%2F2869 > | https://secure-web.cisco.com/1Zegt_Gn2IBgqTP0oVVXaW-DevkpyjF3ysopH2xJUwv37_qzuLYswgriq8Nc59u268Y5WTBWX97BGNreUt_-gGpevznmdMWLcBsjwYaI7Sif52zsGAsTaYv2fQFhwmgff13Cl17cl-oRT5O0f_VKLdrrWbHHQxMYoE9o1zic2BMwGaXsjo5DVUVgF4H7A8rVmuoiEKOFL1FQrM26fHeMOfTcstCW1Z5a1uRVCUhLXDmgGTudC5BmKfYANy6T6uFBEaOQKdf6BUxONpCwijkr09QtQBuWHDYAC_qX3EO__aMwEbWEgDbUAqSkWh7OFpPby/https%3A%2F%2Fgithub.com%2FBioconductor%2FContributions%2Fissues%2F2869 ] > > Comme tu n'as pas de compte personnel github (car CuvierLab est > désormais un compte organization), tu devrais soit créer un compte > github avec ce mail > > ou envoyer un mail à bioc-devel@r-project.org en mettant mon adresse > mail (rob.t...@gmail.com) et ceux que tu veux ajouter en cc dans le mail. > > Avec en en-tête par exemple: Request to add maintainers for HicAggR > > merci, > > On 19/03/2024 10:50, Robel Tesfaye wrote: >> c'est cool merci. >> >> J'ai pensé aux variants justement pour dire que nos associations sont >> "bonnes". >> >> Il y a ce site [ >> https://secure-web.cisco.com/1G6fXBGvL5jOh1VtO00ca_nTjMDoDVfp5HtpJWYdNmFYE_HPqG4xrG_NWB_8piaaHxEUxL2oI9lQ8vveqwSscOE3LpGwqeaS-t_yW8YIsu7pzJLa8SQ68gZMSJnplL_yJdn0jZf3m78AbxpkOxHtb9NRG23dzaiC784Qy3ahO2egIuigfSyqza0blDVNSp2kfK_v6EHYuxEQp0UdlQHWsfSDDLBdqgNXrlhR4JFJ7NiCKpWb9ZKaCsbNh2T4q6YJHCZB-42uqC5CyPkBMcnWk31l7n1EO12XTXHSsa-KaATgElJJePw1Y-NwWuIhXNQuB/https%3A%2F%2Fwww.gtexportal.org%2Fhome%2Fgene%2FZBTB16 >> | https://secure-web.cisco.com/1G6fXBGvL5jOh1VtO00ca_nTjMDoDVfp5HtpJWYdNmFYE_HPqG4xrG_NWB_8piaaHxEUxL2oI9lQ8vveqwSscOE3LpGwqeaS-t_yW8YIsu7pzJLa8SQ68gZMSJnplL_yJdn0jZf3m78AbxpkOxHtb9NRG23dzaiC784Qy3ahO2egIuigfSyqza0blDVNSp2kfK_v6EHYuxEQp0UdlQHWsfSDDLBdqgNXrlhR4JFJ7NiCKpWb9ZKaCsbNh2T4q6YJHCZB-42uqC5CyPkBMcnWk31l7n1EO12XTXHSsa-KaATgElJJePw1Y-NwWuIhXNQuB/https%3A%2F%2Fwww.gtexportal.org%2Fhome%2Fgene%2FZBTB16 ] dans le >> quel sont répertoriés les eQTL de gènes d'intérêt. >> >> On aura peut-être pas les variants pour chacun de nos enhancers mais >> on peut confirmer certaines des associations je pense. >> >> On 19/03/2024 07:44, Olivier Cuvier wrote: >>> Un article à considérer peut-etre... >>> >>> >>> ----- Mail original ----- >>> De: "Olivier Cuvier" <olivier.cuv...@univ-tlse3.fr> >>> À: "Robel Tesfaye" <robel.tesf...@univ-tlse3.fr> >>> Cc: "stephane schaak" <stephane.sch...@inserm.fr>, "Naomi SCHICKELE" >>> <naomi.schick...@univ-tlse3.fr> >>> Envoyé: Lundi 18 Mars 2024 19:11:16 >>> Objet: Re: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and >>> compare_to_background functions >>> >>> Salut Robel, Stéphane, Naomi >>> >>> >>> Merci pour les Figures. Je regarde tout ca. Je ne sais pas sir j'ai >>> déjà dit que j'étais en meeting à Lyon aujourd'hui et demain. Peu >>> importe, c'est cool que tu aies pu regarder les figures de ton coté. >>> On peut en discuter mercredi aprèm si tu veux bien, ou vendredi. >>> Disons que dans les perspectives du papier, il est important pour >>> mon équipe de garder la trame scientifique que nous avions fixé, >>> avec un max de jolis résultats qui sont appuyés par un bon >>> positionnement de l'équipe dans la thématique. Bref, on en discutera. >>> >>> Bonne fin de journée à vous 3 >>> olivier >>> >>> ----- Mail original ----- >>> De: "Robel Tesfaye" <robel.tesf...@univ-tlse3.fr> >>> À: "Olivier Cuvier" <olivier.cuv...@univ-tlse3.fr>, "stephane >>> schaak" <stephane.sch...@inserm.fr>, "Naomi SCHICKELE" >>> <naomi.schick...@univ-tlse3.fr> >>> Envoyé: Lundi 18 Mars 2024 19:03:17 >>> Objet: HicAggR: demo on PlotAPA_byDistance and compare_to_background >>> functions >>> >>> les figures que je vous parlais vendredi. >>> > -- > Robel Tesfaye > Postdoc > Team Chromatin Dynamics and Cell Proliferation > UMR5077 CNRS-UPS, CBI > 169 rue Marianne Grunberg-Manago > 31400 Toulouse -- Robel Tesfaye Postdoc Team Chromatin Dynamics and Cell Proliferation UMR5077 CNRS-UPS, CBI 169 rue Marianne Grunberg-Manago 31400 Toulouse _______________________________________________ Bioc-devel@r-project.org mailing list [ https://secure-web.cisco.com/1AYinIwvuGwGBfW700utMMC5_arfKdtGZ_yEDLH7--9_aB8uTY8ewzKXP9k4vDMgX1yuS6NWuHmivV0s6_O5f46GP5HHDHV41K9H96byvBE-lgNkG8BSJH0a4b33Zt2nEKM7sn0E48RxS2Kth_UANZdE3H2yA76pCbqYbn9Epeee07uaUebfYDaO9p9l_TdFsRwkibj7v4y0OOxcIl6tcNWQx24PMCRKqbTXDDyCmCs3ZBPQcBFDLml_wQnpaV9drwM2qbtIc2UmKItdSpAs9MAPCL9ZihzcNZEDdaK2QHYq9zX7SQT_zKkOvS8fLzB5Y/https%3A%2F%2Fstat.ethz.ch%2Fmailman%2Flistinfo%2Fbioc-devel | https://secure-web.cisco.com/1AYinIwvuGwGBfW700utMMC5_arfKdtGZ_yEDLH7--9_aB8uTY8ewzKXP9k4vDMgX1yuS6NWuHmivV0s6_O5f46GP5HHDHV41K9H96byvBE-lgNkG8BSJH0a4b33Zt2nEKM7sn0E48RxS2Kth_UANZdE3H2yA76pCbqYbn9Epeee07uaUebfYDaO9p9l_TdFsRwkibj7v4y0OOxcIl6tcNWQx24PMCRKqbTXDDyCmCs3ZBPQcBFDLml_wQnpaV9drwM2qbtIc2UmKItdSpAs9MAPCL9ZihzcNZEDdaK2QHYq9zX7SQT_zKkOvS8fLzB5Y/https%3A%2F%2Fstat.ethz.ch%2Fmailman%2Flistinfo%2Fbioc-devel ] This email message may contain legally privileged and/or confidential information. If you are not the intended recipient(s), or the employee or agent responsible for the delivery of this message to the intended recipient(s), you are hereby notified that any disclosure, copying, distribution, or use of this email message is prohibited. If you have received this message in error, please notify the sender immediately by e-mail and delete this email message from your computer. Thank you. [[alternative HTML version deleted]] _______________________________________________ Bioc-devel@r-project.org mailing list https://stat.ethz.ch/mailman/listinfo/bioc-devel